Proces opracowany przez Covaris umożliwia ekstrakcję wysokiej jakości RNA z tkanek FFPE na potrzeby NGS

WOBURN, Massachusetts, 16 grudnia 2014 r. /PRNewswire/ - Covaris, Inc. przedstawia zestaw truXTRAC FFPE RNA. To wysoce innowacyjne rozwiązanie opracowane przez Covaris umożliwia wyodrębnienie wysokiej jakości cząsteczek RNA z pobranych tkanek FFPE, odpowiednich dla przeprowadzenia sekwencjonowania nowej generacji (ang. Next Gen Sequencing, NGS). Jakość właściwą dla NGS uzyskano dzięki zastosowaniu opatentowanej przez Covaris technologii Adaptive Focused Acoustics® (AFA) w połączeniu ze zoptymalizowanym systemem odczynników. Metoda ekstrakcji truXTRAC FFPE RNA wykorzystuje w wysokim stopniu kontrolowaną, skumulowaną energię akustyczną w celu usunięcia parafiny z tkanek zatopionych w parafinie oraz utrwalonych w formalinie (ang. Fixed-Formalin, Paraffin-Embedded, FFPE) bez konieczności zastosowania rozpuszczalników organicznych, co umożliwia skuteczne i szybkie nawodnienie, trawienie tkanki, rewersję połączeń oraz uwolnienie kwasu nukleinowego.

Dzięki zastosowaniu zaawansowanej metodologii, zestaw truXTRAC FFPE RNA umożliwia uzyskanie większej ilości wysokiej jakości cząsteczek RNA, odpowiednich do przeprowadzenia złożonych analiz cząsteczkowych. Dla przykładu, zwiększona zdolność amplifikacji stanowi kluczowy element efektywnego przygotowania biblioteki NGS, zaś zastosowanie metody truXTRAC FFPE RNA prowadzi do wyższej jakości metryki sekwencjonowania, umożliwiając szereg nowych zastosowań klinicznych.

Jim Laugharn, dyrektor generalny Covaris, powiedział: "Analiza transkryptomu staje się standardowym narzędziem oceny rozwoju choroby. Laboratoria kliniczne coraz częściej wykorzystują cząsteczki RNA wyodrębnione z tkanek FFPE, jednak niska jakość RNA uzyskanych tradycyjnymi metodami ekstrakcji sprawia, że cząsteczki te nie nadają się do użytku klinicznego. Opracowany przez Covaris proces wyodrębniania RNA jest w stanie sprostać wrażliwości i wymogom analitycznym związanym z zastosowaniami klinicznymi, w tym przede wszystkim w ramach sekwencjonowania nowej generacji".

Kliniczne próbki tkanek są często stabilizowane w blokach FFPE, aby zachować ich właściwości histologiczne, zaś analiza biochemiczna stanowi sprawę drugorzędną. Utrwalenie w formalinie oraz znaczne odwodnienie tkanek FFPE stanowiło dotąd ogromne wyzwanie w kontekście dokładnej i odpowiedniej ekstrakcji sekwencji RNA na potrzeby NGS. Ponadto proces ten wiązał się ze żmudną procedurą rozkładu i skomplikowanym przepływem prac w warunkach laboratoriów klinicznych. Zestaw truXTRAC FFPE RNA od Covaris pozwala na zastosowanie zaawansowanej technologii preparowania tkanek, a proponowana metodologia cechuje się niezawodnością, reprodukcyjnością i szybkością zastosowania, odpowiadając wymogom laboratoriów klinicznych.

Źródło: Covaris, Inc.