Swift Biosciences wprowadza na rynek panele w leczeniu raka Accel-Amplicon Plus na potrzeby inicjatyw medycyny precyzyjnej

ANN ARBOR, Michigan, 18 kwietnia 2018 r. /PRNewswire/ - Firma Swift Biosciences ogłosiła dzisiaj wprowadzenie na rynek produktu Accel-Amplicon Plus™ Cancer NGS, czyli zestawu dziewięciu paneli dostosowanych do konkretnych nowotworów i genów ułatwiających nakierowane sekwencjonowanie w leczeniu raka. Technologia Accel-Amplicon umożliwia jednoczesne wykrywanie pojedynczych wariantów nukleotydów, kopiowanie wariantów numerycznych oraz przeprowadzanie operacji włączenia i usuwania, co pozwala na osiągnięcie kompleksowego i wybiórczego na poziomie eksonów pokrycia genów istotnych klinicznie. Takie rozwiązanie pozwala badaczom także na połączenie uprzednio zweryfikowanych treści i własnych celów w szybki test w pojedynczej probówce, co z kolei umożliwia opracowywanie szerzej zakrojonych i skalowalnych przepływów pracy pozwalających na skuteczniejszą realizację celów naukowych.

Każdy nowotwór wiąże się z niepowtarzalnym połączeniem zmian genetycznych, które mogą wpływać na szybkość rozwoju guza i jego reakcję na leczenie. Sekwencjonowanie nakierowane z wykorzystaniem precyzyjnych paneli obejmujących wiele genów jest dokładną i kompleksową metodą szybkiej identyfikacji wariantów znanych lub podejrzanych genów nowotworowych, co pozwala na podjęcie działań klinicznych. Jednak tworzenie paneli genów rakowych wymaga doświadczenia w zakresie bioinformatyki koniecznego do identyfikacji markerów genetycznych i posiadania dodatkowych zasobów projektowania, optymalizacji i walidacji testów.

Technologia Accel-Amplicon Plus zapewnia modułowe możliwości łączenia i dopasowywania, które dają laboratoriom translacyjnym większą elastyczność i pozwalają na wdrożenie więcej niż tylko jednej strategii. Laboratoria mogą na przykład rozpocząć pracę od szerokiego zakresu genów pozwalającego na kompleksowe profilowanie guzów, a następnie dopasować treści do najbardziej istotnych markerów. Z drugiej strony mogą też zdecydować się na nakierowane testy pozwalające na rutynowe skanowanie w poszukiwaniu znanych wariantów umożliwiających podjęcie działań klinicznych. Każdy test może być zaprojektowany w sposób obejmujący nawet do 1500 amplikonów na panel. Panele są opracowywane i zatwierdzane w mokrych laboratoriach przez ekspertów firmy Swift i są w pełni kompatybilne z próbkami zdegradowanymi FFPE i rozcieńczonym płynnym materiałem z biopsji.

„Panele Accel-Amplicon Plus mogą zrewolucjonizować badania nad rakiem i w onkologii - skomentował Haley Fiske, główny dyrektor handlowy w firmie Swift Biosciences. - Integracja uprzednio zweryfikowanych i dostosowywalnych treści w jeden panel pozwala badaczom klinicznym na wyciągnięcie jak największej ilości danych z każdej próbki. Dzięki temu ich dążenia do zidentyfikowania i wykrycia wariantów rakowych znacznie przyspieszą” - dodał dyrektor.

Panele w leczeniu raka Accel-Amplicon Plus obejmują dziewięć testów przedstawionych poniżej.

Panele chorobowe:

• Accel-Amplicon Plus™ Colorectal Cancer Panel
• Accel-Amplicon Plus™ Lynch Syndrome Panel
• Accel-Amplicon Plus™ Lung Cancer Panel
• Accel-Amplicon Plus™ Myeloid Panel

Panele genetyczne:

• Accel-Amplicon Plus™ 57G Pan-Cancer Profiling Panel
• Accel-Amplicon Plus™ Comprehensive TP53 Gene Panel
• Accel-Amplicon Plus™ BRCA1 and BRCA2 Gene Panel
• Accel-Amplicon Plus™ BRCA 1, BRCA 2 and PALB 2 Gene Panel
• Accel-Amplicon Plus™ EGFR Pathway Panel

Do głównych funkcji i zalet paneli Accel-Amplicon Plus Cancer NGS należy:

• objęcie tysięcy klinicznie istotnych mutacji znajdujących się w bazach danych COSMIC i ClinVar, w tym mutacji w najbardziej narażonych regionach oraz na poziomie eksonów lub całych genów przy kluczowych genach;

• wykrywanie rzadkich wariantów alleli występujących w poniżej 1% przypadków pozwalające na wykrycie mutacji linii greminalnych i somatycznych w tym samym teście;

• zapewnianie dobrych wyników przy wykorzystaniu zaledwie 10 nanogramów próbki z próbek zdegradowanych FFPE lub ograniczonych, na przykład z bezkomórkowego DNA, biopsji aspiracyjnej cienkoigłowej lub innych biopsji na małą skalę;

• kompatybilność z rozwiązaniami sekwencjonowania Illumina.

Panele zapewniają wyniki zawierające dużo informacji, a przy tym opierają się na prostym protokole i solidnych wynikach, dlatego też mogą być stosowane w kilku zastosowaniach onkologicznych o znaczeniu krytycznym, w tym:

• wykrywanie i potwierdzanie wariantów somatycznych w niskich częstotliwościach,

• profilowanie nowotworów w świeżych lub zakonserwowanych próbkach,

• testy przesiewowe na podatność na chorobę, wczesne wykrywanie i nawroty,

• terapeutyczna wydajność i monitorowanie.

Wraz z wprowadzeniem na rynek paneli Accel-Amplicon Plus firma udostępniła także bazę informacji Swift Bioinformatics Resources, która umożliwia dostęp do otwartych i komercyjnych rozwiązań pozwalających na przyspieszenie analizy dużych zestawów danych NGS. Pierwsze dwa narzędzia umożliwiają wykorzystanie przepływów pracy ponownego sekwencjonowania nakierowanego, w tym Primerclip™, czyli narzędzia typu open source umożliwiające przeprowadzanie tzw. primer trimming oraz FAST Analysis™, oprogramowania intuicyjnego wykrywania wariantów firmy Genialis, które pozwala na płynną integrację ujednolicania, typowania alleli i podsumowywania wyników.

Panele Accel-Amplicon Plus Cancer NGS są już dostępne do zakupu. Więcej informacji można znaleźć na stronie www.swiftbiosci.com.

O Swift Biosciences

Firma Swift Biosciences specjalizuje się w tzw. NGS Library Prep. Z siedziby w Ann Arbor w stanie Michigan firma opracowuje nowatorskie rozwiązania przygotowywania bibliotek w najnowszych zastosowaniach opartych na sekwencjonowaniu nowej generacji, w tym sekwencjonowaniu całego genomu, wybiórczego sekwencjonowania DNA i analizy epigenetycznej.

Produkty firmy Swift Biosciences powstają w celu ułatwienia klientom szybszej, łatwiejszej i dokładniejszej analizy skomplikowanych próbek natury biologicznej przy zachowaniu kompatybilności z wiodącymi narzędziami. Firma Swift Biosciences jako pierwsza na świecie oferuje rozwiązania przygotowywania bibliotek na trzy wiodące platformy sekwencjonowania: Pacific Biosciences®, Illumina® i Ion Torrent™.

Firma rozpoczęła działalność w lutym 2010 r., a tworzone przez nią produkty umożliwiają nowe zastosowania w wielu branżach, w tym w agrigenomice, farmaceutyce, nauce, biotechnologii i onkologii.

Więcej informacji można znaleźć na stronie SwiftBioSci.com lub na profile firmy Swift Biosciences w serwisie Twitter (@SwiftBioSci).

Źródło: Swift Biosciences